La finalidad y el alcance del nuevo Reglamento son "prevenir la propagación internacional de enfermedades, proteger contra esa propagación, controlarla y darle una respuesta de salud pública de forma proporcionada con los riesgos y las amenazas para la salud pública y evitando al mismo tiempo las interferencias innecesarias con el tráfico internacional". Este nuevo reglamento contiene varias novedades sin precedentes y entrará en vigor en junio de 2007. En las nuevas disposiciones se han revisado y puesto al día también muchas de las funciones reguladoras técnicas y de otro tipo, en particular los certificados para los viajes y transportes internacionales, así como los requisitos para los puertos y aeropuertos internacionales y los pasos fronterizos terrestres.